灵谷寺玄奘院地宫将作为玄奘顶骨的永久存放和供奉之地，供香客和游客前来瞻礼。
公元664年,玄奘法师圆寂,葬于长安兴教寺墓地,后迁至终南山紫阁寺安葬。公元998年,金陵天禧寺住持可政来此朝拜,在危旧的寺塔中发现玄奘顶骨,不远千里背回天禧寺供奉。1943年,侵华日军从南京三藏塔遗址发掘出安放玄奘顶骨的石函,交涉后将顶骨分为三份,其中一份存放于南京鸡鸣寺山下当时的汪伪中央文物保管委员会。1973年,南京灵谷寺修复开放,将存放于文管会的顶骨迎回,后建玄奘院、造金丝楠木纯金构建玄奘大师顶骨舍利塔进行供奉。
